PCR വർക്ക്ഫ്ലോകൾ (സ്റ്റാൻഡേർഡൈസേഷനിലൂടെ ഗുണമേന്മ മെച്ചപ്പെടുത്തൽ)

പ്രക്രിയകളുടെ സ്റ്റാൻഡേർഡൈസേഷനിൽ അവയുടെ ഒപ്റ്റിമൈസേഷനും തുടർന്നുള്ള സ്ഥാപനവും സമന്വയവും ഉൾപ്പെടുന്നു, ഇത് ഉപയോക്താവിൽ നിന്ന് സ്വതന്ത്രമായി ദീർഘകാല ഒപ്റ്റിമൽ പ്രകടനം അനുവദിക്കുന്നു. സ്റ്റാൻഡേർഡൈസേഷൻ ഉയർന്ന നിലവാരമുള്ള ഫലങ്ങളും അവയുടെ പുനരുൽപാദനക്ഷമതയും താരതമ്യവും ഉറപ്പാക്കുന്നു.

(ക്ലാസിക്) പിസിആറിൻ്റെ ലക്ഷ്യം വിശ്വസനീയവും പുനരുൽപ്പാദിപ്പിക്കാവുന്നതുമായ ഒരു ഫലത്തിൻ്റെ തലമുറയാണ്. ചില ആപ്ലിക്കേഷനുകൾക്ക്, ഇതിൻ്റെ വിളവ്PCR ഉൽപ്പന്നംപ്രസക്തവുമാണ്. ഈ പ്രതികരണങ്ങൾക്കായി, സാമ്പിളുകൾ വിട്ടുവീഴ്ച ചെയ്യപ്പെടുന്നില്ലെന്നും പിസിആർ വർക്ക്ഫ്ലോ സ്ഥിരതയുള്ളതാണെന്നും ഉറപ്പാക്കാൻ ശ്രദ്ധിക്കേണ്ടതുണ്ട്. പ്രത്യേകിച്ചും, തെറ്റായ പോസിറ്റീവ് അല്ലെങ്കിൽ തെറ്റായ നെഗറ്റീവ് ഫലങ്ങളിലേക്ക് നയിച്ചേക്കാവുന്ന അല്ലെങ്കിൽ പിസിആർ പ്രതികരണത്തെ പോലും തടയുന്ന മലിനീകരണത്തിൻ്റെ ആമുഖം കുറയ്ക്കുന്നതിന് ഇത് വിവർത്തനം ചെയ്യുന്നു. കൂടാതെ, ഒരു റണ്ണിനുള്ളിലെ ഓരോ വ്യക്തിഗത സാമ്പിളിനും പ്രതികരണ വ്യവസ്ഥകൾ കഴിയുന്നത്ര സമാനമായിരിക്കണം കൂടാതെ തുടർന്നുള്ള പ്രതികരണങ്ങളിലേക്കും (അതേ രീതിയുടെ) കൈമാറ്റം ചെയ്യാവുന്നതാണ്. ഇത് പ്രതികരണങ്ങളുടെ ഘടനയെയും സൈക്ലറിലെ താപനില നിയന്ത്രണത്തിൻ്റെ തരത്തെയും സൂചിപ്പിക്കുന്നു. ഉപയോക്തൃ പിശകുകൾ, തീർച്ചയായും, കഴിയുന്നത്ര ഒഴിവാക്കേണ്ടതാണ്.

പിസിആർ തയ്യാറാക്കുന്ന സമയത്തും അതിൻ്റെ നടത്തിപ്പിലുടനീളം നേരിടുന്ന വെല്ലുവിളികളും - പിസിആർ വർക്ക്ഫ്ലോകളുടെ സ്റ്റാൻഡേർഡൈസേഷനായി ഉപയോഗിക്കുന്ന ഉപകരണങ്ങളും ഉപഭോഗവസ്തുക്കളും സംബന്ധിച്ച് നിലവിലുള്ള പരിഹാരങ്ങളിലേക്കുള്ള സമീപനങ്ങളും ഞങ്ങൾ ചുവടെ പ്രദർശിപ്പിക്കും.

പ്രതികരണ തയ്യാറെടുപ്പ്

പ്രതിപ്രവർത്തന ഘടകങ്ങൾ യഥാക്രമം പിസിആർ-പാത്രങ്ങളിലേക്കോ പ്ലേറ്റുകളിലേക്കോ വിതരണം ചെയ്യുന്നത് ഒന്നിലധികം വെല്ലുവിളികൾ ഉൾക്കൊള്ളുന്നു, അവ മറികടക്കേണ്ടതുണ്ട്:

പ്രതികരണ വ്യവസ്ഥകൾ

സാധ്യമായ ഏറ്റവും സമാനമായ പ്രതികരണ സാഹചര്യങ്ങൾ ലക്ഷ്യം വയ്ക്കുമ്പോൾ വ്യക്തിഗത ഘടകങ്ങളുടെ കൃത്യവും കൃത്യവുമായ ഡോസ് ഒഴിച്ചുകൂടാനാവാത്തതാണ്. ഒരു നല്ല പൈപ്പിംഗ് സാങ്കേതികതയ്ക്ക് പുറമേ, ശരിയായ ഉപകരണം തിരഞ്ഞെടുക്കുന്നത് നിർണായകമാണ്. പിസിആർ മാസ്റ്റർ-മിക്‌സുകളിൽ വിസ്കോസിറ്റി വർദ്ധിപ്പിക്കുന്നതോ നുരയെ സൃഷ്ടിക്കുന്നതോ ആയ പദാർത്ഥങ്ങൾ പതിവായി അടങ്ങിയിരിക്കുന്നു. പൈപ്പ് ചെയ്യൽ പ്രക്രിയയിൽ, ഇവ ഗണ്യമായ നനവിലേക്ക് നയിക്കുന്നുപൈപ്പറ്റ് നുറുങ്ങുകൾ, അങ്ങനെ പൈപ്പറ്റിംഗ് കൃത്യത കുറയ്ക്കുന്നു. ഡയറക്ട് ഡിസ്പെൻസിങ് സിസ്റ്റങ്ങളുടെ ഉപയോഗം അല്ലെങ്കിൽ നനവുള്ള സാധ്യത കുറവുള്ള ഇതര പൈപ്പറ്റ് ടിപ്പുകൾ പൈപ്പറ്റിംഗ് പ്രക്രിയയുടെ കൃത്യതയും കൃത്യതയും മെച്ചപ്പെടുത്തും.

മലിനീകരണം

വിതരണം ചെയ്യുന്ന പ്രക്രിയയിൽ, പൈപ്പറ്റിൻ്റെ ഉള്ളിൽ എത്താൻ അനുവദിച്ചാൽ, അടുത്ത പൈപ്പിംഗ് ഘട്ടത്തിൽ മറ്റൊരു സാമ്പിളിനെ മലിനമാക്കാൻ സാധ്യതയുള്ള എയറോസോളുകൾ സൃഷ്ടിക്കപ്പെടുന്നു. ഫിൽട്ടർ ടിപ്പുകളോ നേരിട്ടുള്ള സ്ഥാനചലന സംവിധാനങ്ങളോ ഉപയോഗിച്ച് ഇത് തടയാം.
പോലുള്ള ഉപഭോഗവസ്തുക്കൾനുറുങ്ങുകൾ, PCR വർക്ക്ഫ്ലോയിൽ ഉപയോഗിക്കുന്ന പാത്രങ്ങളിലും പ്ലേറ്റുകളിലും സാമ്പിളിൽ വിട്ടുവീഴ്ച ചെയ്യുന്നതോ ഫലത്തെ തെറ്റിദ്ധരിപ്പിക്കുന്നതോ ആയ പദാർത്ഥങ്ങൾ അടങ്ങിയിരിക്കരുത്. ഇവയിൽ DNA, DNases, RNases, PCR ഇൻഹിബിറ്ററുകൾ എന്നിവയും പ്രതിപ്രവർത്തന സമയത്ത് മെറ്റീരിയലിൽ നിന്ന് ചോർന്നുപോകാൻ സാധ്യതയുള്ള ഘടകങ്ങളും ഉൾപ്പെടുന്നു - ലീച്ചബിൾസ് എന്നറിയപ്പെടുന്ന പദാർത്ഥങ്ങൾ.

ഉപയോക്തൃ പിശക്

കൂടുതൽ സാമ്പിളുകൾ പ്രോസസ്സ് ചെയ്യുന്നു, പിശക് സാധ്യത കൂടുതലാണ്. തെറ്റായ പാത്രത്തിലേക്കോ തെറ്റായ കിണറ്റിലേക്കോ ഒരു സാമ്പിൾ പൈപ്പ് ചെയ്യുന്നത് എളുപ്പത്തിൽ സംഭവിക്കാം. കിണറുകൾ എളുപ്പത്തിൽ തിരിച്ചറിയാൻ കഴിയുന്ന അടയാളപ്പെടുത്തൽ വഴി ഈ അപകടസാധ്യത ഗണ്യമായി കുറയ്ക്കാൻ കഴിയും. വിതരണം ചെയ്യുന്ന ഘട്ടങ്ങളുടെ ഓട്ടോമേഷൻ വഴി, "മാനുഷിക ഘടകം", അതായത്, പിശകുകളും ഉപയോക്തൃ സംബന്ധിയായ വ്യതിയാനങ്ങളും കുറയ്ക്കുന്നു, അങ്ങനെ പുനരുൽപാദനക്ഷമത വർദ്ധിക്കുന്നു, പ്രത്യേകിച്ച് ചെറിയ പ്രതികരണ വോള്യങ്ങളുടെ കാര്യത്തിൽ. ഇതിന് ഒരു വർക്ക്സ്റ്റേഷനിൽ ആവശ്യത്തിന് ഡൈമൻഷണൽ സ്ഥിരതയുള്ള പ്ലേറ്റുകൾ ആവശ്യമാണ്. അറ്റാച്ച് ചെയ്‌ത ബാർകോഡുകൾ അധിക മെഷീൻ റീഡബിലിറ്റി നൽകുന്നു, ഇത് മുഴുവൻ പ്രക്രിയയിലുടനീളം സാമ്പിൾ ട്രാക്കിംഗ് ലളിതമാക്കുന്നു.

തെർമോസൈക്ലറിൻ്റെ പ്രോഗ്രാമിംഗ്

ഒരു ഉപകരണം പ്രോഗ്രാമിംഗ് ചെയ്യുന്നത് സമയമെടുക്കുന്നതും പിശക് സാധ്യതയുള്ളതുമാണെന്ന് തെളിയിക്കാനാകും. ഈ പ്രക്രിയയുടെ ഘട്ടം ലളിതമാക്കുന്നതിനും ഏറ്റവും പ്രധാനമായി, ഇത് സുരക്ഷിതമാക്കുന്നതിനും വ്യത്യസ്ത PCR തെർമൽ സൈക്ലർ സവിശേഷതകൾ ഒരുമിച്ച് പ്രവർത്തിക്കുന്നു:
എളുപ്പമുള്ള പ്രവർത്തനവും നല്ല ഉപയോക്തൃ മാർഗ്ഗനിർദ്ദേശവുമാണ് കാര്യക്ഷമമായ പ്രോഗ്രാമിംഗിൻ്റെ അടിസ്ഥാനം. ഈ അടിത്തറയുടെ അടിസ്ഥാനത്തിൽ, പാസ്‌വേഡ് പരിരക്ഷിത ഉപയോക്തൃ അഡ്മിനിസ്ട്രേഷൻ സ്വന്തം പ്രോഗ്രാമുകൾ മറ്റ് ഉപയോക്താക്കൾ മാറ്റുന്നതിൽ നിന്ന് തടയും. ഒന്നിലധികം സൈക്ലറുകൾ (ഒരേ തരത്തിലുള്ള) ഉപയോഗത്തിലാണെങ്കിൽ, USB അല്ലെങ്കിൽ കണക്റ്റിവിറ്റി വഴി ഒരു പ്രോഗ്രാമിനെ ഒരു ഉപകരണത്തിൽ നിന്ന് മറ്റൊന്നിലേക്ക് നേരിട്ട് കൈമാറാൻ കഴിയുമെങ്കിൽ അത് പ്രയോജനകരമാണ്. ഒരു കമ്പ്യൂട്ടറിലെ പ്രോഗ്രാമുകൾ, ഉപയോക്തൃ അവകാശങ്ങൾ, പ്രമാണങ്ങൾ എന്നിവയുടെ കേന്ദ്രവും സുരക്ഷിതവുമായ അഡ്മിനിസ്ട്രേഷൻ കമ്പ്യൂട്ടർ സോഫ്റ്റ്വെയർ പ്രാപ്തമാക്കുന്നു.

പിസിആർ റൺ

ഓട്ടത്തിനിടയിൽ, പ്രതികരണ പാത്രത്തിൽ ഡിഎൻഎ വർധിപ്പിക്കുന്നു, അവിടെ ഓരോ സാമ്പിളും സമാനവും സ്ഥിരവുമായ പ്രതികരണ വ്യവസ്ഥകൾക്ക് വിധേയമാക്കണം. പ്രക്രിയയ്ക്ക് ഇനിപ്പറയുന്ന വശങ്ങൾ പ്രസക്തമാണ്:

താപനില നിയന്ത്രണം

താപനിയന്ത്രണത്തിലെ മികച്ച കൃത്യതയും സൈക്ലർ ബ്ലോക്കിൻ്റെ ഏകതാനതയും എല്ലാ സാമ്പിളുകളുടെയും ഊഷ്മാവ് കണ്ടീഷനിംഗിന് അടിസ്ഥാനമാണ്. ഹീറ്റിംഗ്, കൂളിംഗ് മൂലകങ്ങളുടെ (പെൽറ്റിയർ മൂലകങ്ങൾ) ഉയർന്ന നിലവാരമുള്ളതും, ഇവ ബ്ലോക്കുമായി ബന്ധിപ്പിച്ചിരിക്കുന്ന രീതിയും, "എഡ്ജ് ഇഫക്റ്റ്" എന്നറിയപ്പെടുന്ന താപനില വ്യത്യാസങ്ങളുടെ അപകടസാധ്യത നിർണ്ണയിക്കുന്ന നിർണ്ണായക ഘടകങ്ങളാണ്.

ബാഷ്പീകരണം

ബാഷ്പീകരണം മൂലം പ്രതികരണത്തിൻ്റെ ഗതിയിൽ വ്യക്തിഗത പ്രതിപ്രവർത്തന ഘടകങ്ങളുടെ സാന്ദ്രത മാറരുത്. അല്ലെങ്കിൽ, അത് വളരെ കുറവായിരിക്കാംPCR ഉൽപ്പന്നംസൃഷ്ടിക്കപ്പെടാം, അല്ലെങ്കിൽ ഒന്നുമില്ല. അതിനാൽ സുരക്ഷിതമായ ഒരു മുദ്ര ഉറപ്പാക്കി ബാഷ്പീകരണം കുറയ്ക്കേണ്ടത് വളരെ പ്രധാനമാണ്. ഈ സാഹചര്യത്തിൽ, തെർമോസൈക്ലറിൻ്റെ ചൂടായ ലിഡും പാത്രത്തിൻ്റെ മുദ്രയും കൈകോർത്ത് പ്രവർത്തിക്കുന്നു. വ്യത്യസ്ത സീലിംഗ് ഓപ്ഷനുകൾ ലഭ്യമാണ്PCR പ്ലേറ്റുകൾ (ലിങ്ക്: സീലിംഗ് ലേഖനം), ഹീറ്റ് സീലിംഗിലൂടെ മികച്ച മുദ്ര കൈവരിക്കുന്നു. സൈക്ലർ ലിഡിൻ്റെ കോൺടാക്റ്റ് മർദ്ദം തിരഞ്ഞെടുത്ത സീലിലേക്ക് ക്രമീകരിക്കാൻ കഴിയുന്നിടത്തോളം, മറ്റ് അടച്ചുപൂട്ടലുകളും അനുയോജ്യമായേക്കാം.

ദീർഘകാലാടിസ്ഥാനത്തിൽ കൃത്യവും പുനരുൽപ്പാദിപ്പിക്കാവുന്നതുമായ ഫലങ്ങൾ സംരക്ഷിക്കുന്നതിനായി പ്രോസസ് സ്റ്റാൻഡേർഡൈസേഷൻ നിലവിലുണ്ട്. ഉപകരണങ്ങളുടെ പതിവ് അറ്റകുറ്റപ്പണികൾ ഇതിൽ ഉൾപ്പെടുന്നു, അത് എല്ലായ്പ്പോഴും നല്ല പ്രവർത്തനാവസ്ഥയിലാണെന്ന് ഉറപ്പാക്കുന്നു. എല്ലാ ഉപഭോഗവസ്തുക്കളും ഉൽപ്പാദിപ്പിക്കുന്ന എല്ലാ സ്ഥലങ്ങളിലും സ്ഥിരമായി ഉയർന്ന നിലവാരമുള്ളതായിരിക്കണം, മാത്രമല്ല അവയുടെ വിശ്വസനീയമായ ലഭ്യത ഉറപ്പുനൽകുകയും വേണം.

 


പോസ്റ്റ് സമയം: നവംബർ-29-2022