নিউক্লিক অ্যাসিড নিষ্কাশন এবং চৌম্বকীয় গুটিকা পদ্ধতি

ভূমিকা

নিউক্লিক অ্যাসিড নিষ্কাশন কি?

খুব সহজ শর্তে, নিউক্লিক অ্যাসিড নিষ্কাশন হল একটি নমুনা থেকে আরএনএ এবং/অথবা ডিএনএ অপসারণ এবং সমস্ত অতিরিক্ত যা প্রয়োজনীয় নয়। নিষ্কাশনের প্রক্রিয়াটি একটি নমুনা থেকে নিউক্লিক অ্যাসিডগুলিকে বিচ্ছিন্ন করে এবং একটি ঘনীভূত ইলুয়েট আকারে সেগুলিকে উৎপন্ন করে, তরল এবং দূষিত পদার্থগুলি থেকে মুক্ত যা যে কোনও ডাউনস্ট্রিম অ্যাপ্লিকেশনকে প্রভাবিত করতে পারে।

নিউক্লিক অ্যাসিড নিষ্কাশন অ্যাপ্লিকেশন

বিশুদ্ধ নিউক্লিক অ্যাসিডগুলি একাধিক বিভিন্ন শিল্প জুড়ে বিভিন্ন অ্যাপ্লিকেশনের আধিক্যে ব্যবহৃত হয়। স্বাস্থ্যসেবা সম্ভবত এমন একটি এলাকা যেখানে এটি সবচেয়ে বেশি ব্যবহার করা হয়, বিভিন্ন পরীক্ষার উদ্দেশ্যে বিশুদ্ধ আরএনএ এবং ডিএনএ প্রয়োজন।

স্বাস্থ্যসেবাতে নিউক্লিক অ্যাসিড নিষ্কাশনের অ্যাপ্লিকেশনগুলির মধ্যে রয়েছে:

- পিসিআর এবং কিউপিসিআর প্রশস্তকরণ

- নেক্সট জেনারেশন সিকোয়েন্সিং (এনজিএস)

- পরিবর্ধন-ভিত্তিক SNP জিনোটাইপিং

- অ্যারে-ভিত্তিক জিনোটাইপিং

- সীমাবদ্ধতা এনজাইম হজম

- পরিবর্তিত এনজাইম ব্যবহার করে বিশ্লেষণ (যেমন লিগেশন এবং ক্লোনিং)

স্বাস্থ্যসেবার বাইরেও অন্যান্য ক্ষেত্র রয়েছে যেখানে নিউক্লিক অ্যাসিড নিষ্কাশন ব্যবহার করা হয়, পিতৃত্ব পরীক্ষা, ফরেনসিক এবং জিনোমিক্স সহ কিন্তু সীমাবদ্ধ নয়।

নিউক্লিক অ্যাসিড নিষ্কাশনের একটি সংক্ষিপ্ত ইতিহাস

ডিএনএ নিষ্কাশন1869 সালে ফ্রেডরিখ মিশার নামে একজন সুইস চিকিত্সক দ্বারা প্রথম পরিচিত বিচ্ছিন্নতা সম্পাদিত হয়েছিল। মিশার কোষের রাসায়নিক গঠন নির্ধারণ করে জীবনের মৌলিক নীতিগুলি সমাধান করার আশা করছিলেন। লিম্ফোসাইটের সাথে ব্যর্থ হওয়ার পর, তিনি ফেলে দেওয়া ব্যান্ডেজের পুঁজে পাওয়া লিউকোসাইট থেকে ডিএনএর একটি অপরিশোধিত অবক্ষয় পেতে সক্ষম হন। তিনি কোষের সাইটোপ্লাজম ত্যাগ করার জন্য কোষে অ্যাসিড এবং তারপর ক্ষার যোগ করে এটি করেছিলেন এবং তারপর ডিএনএকে অন্যান্য প্রোটিন থেকে আলাদা করার জন্য একটি প্রোটোকল তৈরি করেছিলেন।

Miescher এর যুগান্তকারী গবেষণা অনুসরণ করে, অন্যান্য অনেক বিজ্ঞানী ডিএনএ বিচ্ছিন্ন এবং বিশুদ্ধ করার কৌশলগুলি অগ্রসর এবং বিকাশের জন্য এগিয়ে গেছেন। এডউইন জোসেফ কোহন, একজন প্রোটিন বিজ্ঞানী দ্বিতীয় বিশ্বযুদ্ধের সময় প্রোটিন পরিশোধনের জন্য অনেক কৌশল তৈরি করেছিলেন। তিনি রক্তের প্লাজমার সিরাম অ্যালবুমিন ভগ্নাংশকে বিচ্ছিন্ন করার জন্য দায়ী ছিলেন, যা রক্তনালীতে অসমোটিক চাপ বজায় রাখতে গুরুত্বপূর্ণ। সৈন্যদের বাঁচিয়ে রাখার জন্য এটি অত্যন্ত গুরুত্বপূর্ণ ছিল।

1953 সালে ফ্রান্সিস ক্রিক, রোজালিন্ড ফ্র্যাঙ্কলিন এবং জেমস ওয়াটসনের সাথে, ডিএনএর গঠন নির্ধারণ করেন, যা দেখায় যে এটি নিউক্লিক অ্যাসিড নিউক্লিওটাইডের দীর্ঘ চেইনের দুটি স্ট্র্যান্ড দিয়ে তৈরি। এই যুগান্তকারী আবিষ্কারটি মেসেলসন এবং স্টাহলের জন্য পথ প্রশস্ত করেছিল, যারা তাদের 1958 সালের পরীক্ষার সময় ডিএনএ-এর আধা-রক্ষণশীল প্রতিলিপি প্রদর্শন করে ই. কোলি ব্যাকটেরিয়া থেকে ডিএনএ বিচ্ছিন্ন করার জন্য একটি ঘনত্ব গ্রেডিয়েন্ট সেন্ট্রিফিউগেশন প্রোটোকল তৈরি করতে সক্ষম হয়েছিল।

নিউক্লিক অ্যাসিড নিষ্কাশনের কৌশল

ডিএনএ নিষ্কাশনের 4টি ধাপ কী কী?
সমস্ত নিষ্কাশন পদ্ধতি একই মৌলিক ধাপে ফুটে ওঠে।

কোষের ব্যাঘাত. এই পর্যায়, যা সেল লাইসিস নামেও পরিচিত, এতে কোষ প্রাচীর এবং/অথবা কোষের ঝিল্লি ভেঙ্গে ফেলা হয়, যাতে আগ্রহের নিউক্লিক অ্যাসিড ধারণকারী আন্তঃকোষীয় তরল মুক্ত হয়।

অবাঞ্ছিত ধ্বংসাবশেষ অপসারণ. এর মধ্যে রয়েছে ঝিল্লির লিপিড, প্রোটিন এবং অন্যান্য অবাঞ্ছিত নিউক্লিক অ্যাসিড যা ডাউনস্ট্রিম অ্যাপ্লিকেশনগুলিতে হস্তক্ষেপ করতে পারে।

আলাদা করা। আপনার তৈরি করা ক্লিয়ারড লাইসেট থেকে আগ্রহের নিউক্লিক অ্যাসিডগুলিকে আলাদা করার বিভিন্ন উপায় রয়েছে, যা দুটি প্রধান বিভাগের মধ্যে পড়ে: সমাধান ভিত্তিক বা কঠিন অবস্থা (পরবর্তী বিভাগটি দেখুন)।

একাগ্রতা। নিউক্লিক অ্যাসিডগুলিকে অন্যান্য সমস্ত দূষক এবং তরল পদার্থ থেকে বিচ্ছিন্ন করার পরে, সেগুলি একটি উচ্চ-ঘনিষ্ঠ ইলুয়েটে উপস্থাপন করা হয়।

নিষ্কাশন দুই ধরনের
নিউক্লিক অ্যাসিড নিষ্কাশন দুই ধরনের আছে - সমাধান ভিত্তিক পদ্ধতি এবং কঠিন অবস্থা পদ্ধতি। সমাধান ভিত্তিক পদ্ধতিটি রাসায়নিক নিষ্কাশন পদ্ধতি হিসাবেও পরিচিত, কারণ এটি কোষকে ভেঙে নিউক্লিক উপাদান অ্যাক্সেস করতে রাসায়নিক ব্যবহার করে। এটি হয় জৈব যৌগ যেমন ফেনল এবং ক্লোরোফর্ম ব্যবহার করতে পারে, অথবা কম ক্ষতিকারক এবং তাই প্রোটিনেজ কে বা সিলিকা জেলের মতো আরও প্রস্তাবিত অজৈব যৌগ ব্যবহার করতে পারে।

একটি কোষ ভেঙে ফেলার জন্য বিভিন্ন রাসায়নিক নিষ্কাশন পদ্ধতির উদাহরণগুলির মধ্যে রয়েছে:

- ঝিল্লির অসমোটিক ফেটে যাওয়া

- কোষ প্রাচীরের এনজাইমেটিক হজম

- ঝিল্লির দ্রবণীয়করণ

- ডিটারজেন্ট দিয়ে

- ক্ষার চিকিত্সার সাথে

সলিড স্টেট কৌশল, যা যান্ত্রিক পদ্ধতি নামেও পরিচিত, এতে ডিএনএ কীভাবে একটি কঠিন স্তরের সাথে মিথস্ক্রিয়া করে তা শোষণ করে। একটি গুটিকা বা অণু নির্বাচন করে যা ডিএনএ আবদ্ধ করবে কিন্তু বিশ্লেষক তা করবে না, দুটিকে আলাদা করা সম্ভব। সিলিকা এবং চৌম্বক পুঁতি ব্যবহার সহ সলিড-ফেজ নিষ্কাশন কৌশলগুলির উদাহরণ।

চৌম্বক গুটিকা নিষ্কাশন ব্যাখ্যা

চৌম্বক গুটিকা নিষ্কাশন পদ্ধতি
চৌম্বক পুঁতি ব্যবহার করে নিষ্কাশনের সম্ভাব্যতা প্রথমে হোয়াইটহেড ইনস্টিটিউট গবেষণা প্রতিষ্ঠানের জন্য ট্রেভর হকিন্স দ্বারা দায়ের করা মার্কিন পেটেন্টে স্বীকৃত হয়েছিল। এই পেটেন্ট স্বীকার করেছে যে জিনগত উপাদানগুলিকে শক্ত সমর্থন বাহকের সাথে আবদ্ধ করে বের করা সম্ভব ছিল, যা একটি চৌম্বকীয় গুটিকা হতে পারে। নীতিটি হল যে আপনি একটি অত্যন্ত কার্যকরী চৌম্বক পুঁতি ব্যবহার করেন যার উপর জেনেটিক উপাদান আবদ্ধ হবে, যা নমুনা ধারণ করা জাহাজের বাইরের দিকে একটি চৌম্বকীয় শক্তি প্রয়োগ করে সুপারনাট্যান্ট থেকে আলাদা করা যেতে পারে।

কেন চৌম্বক পুঁতি নিষ্কাশন ব্যবহার?
চৌম্বকীয় গুটিকা নিষ্কাশন প্রযুক্তি ক্রমবর্ধমানভাবে প্রচলিত হয়ে উঠছে, সম্ভাব্যতার কারণে এটি দ্রুত এবং দক্ষ নিষ্কাশন পদ্ধতির জন্য ধারণ করে। সাম্প্রতিক সময়ে উপযুক্ত বাফার সিস্টেমের সাথে অত্যন্ত কার্যকরী চৌম্বক পুঁতির উন্নয়ন হয়েছে, যা নিউক্লিক অ্যাসিড নিষ্কাশনের অটোমেশন এবং একটি কর্মপ্রবাহকে সম্ভব করেছে যা খুব হালকা এবং সাশ্রয়ী। এছাড়াও, চৌম্বকীয় গুটিকা নিষ্কাশন পদ্ধতিগুলি সেন্ট্রিফিউগেশন পদক্ষেপগুলিকে জড়িত করে না যা শিয়ার ফোর্স সৃষ্টি করতে পারে যা ডিএনএর দীর্ঘ টুকরোগুলিকে ভেঙে দেয়। এর মানে হল যে ডিএনএর দীর্ঘ স্ট্র্যান্ডগুলি অক্ষত থাকে, যা জিনোমিক্স পরীক্ষায় গুরুত্বপূর্ণ।